中國構(gòu)建起目前全球最完整海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫
中新社青島9月5日電 (胡耀杰 張孝鵬)“千種海洋生物基因測序項目”暨全球海洋微生物基因庫建設(shè)及應(yīng)用成果聯(lián)合發(fā)布會5日在山東青島舉行。記者從會上獲悉，華大生命科學(xué)研究院與山東大學(xué)等共同構(gòu)建了目前全球最完整海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫The Global Ocean Microbiome Catalogue(GOMC)，并從中發(fā)現(xiàn)大量有應(yīng)用潛力的基因資源。
據(jù)華大生命科學(xué)研究院研究員范廣益介紹，GOMC是已公開海洋基因組數(shù)據(jù)庫Tara Ocean的3倍、蛋白序列庫的60倍。目前，GOMC已存儲于中國的國家基因庫生命大數(shù)據(jù)平臺，對具有應(yīng)用潛力基因資源的相關(guān)研究成果已在學(xué)術(shù)期刊《自然》(Nature)上發(fā)表。
據(jù)介紹，GOMC的構(gòu)建過程中，科研人員對目前已公開的近240Tb海洋微生物宏基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行了重分析。GOMC擁有超4.31萬個海洋微生物基因組和24.58億個基因序列，其中有2萬余個微生物是潛在新發(fā)現(xiàn)物種，近1萬個微生物是在獨特生境中首次發(fā)現(xiàn)。
GOMC的研究過程中，科研人員挖掘出1個具有潛在應(yīng)用價值的新型Cas9編輯系統(tǒng)(Om1Cas9)，將助力中國在基因編輯工具使用上具有更多獨立性和選擇；發(fā)現(xiàn)10個具有顯著抗菌活性及廣譜抗菌效果的新型抗菌肽，該成果的應(yīng)用或?qū)榭股啬退幮噪y題提供新解決方案；發(fā)掘3個深海來源的高活性新型嗜鹽PET塑料降解酶，或?qū)⒅崿F(xiàn)PET塑料的綠色低碳可持續(xù)利用。
據(jù)悉，GOMC是中國(山東)自貿(mào)試驗區(qū)青島片區(qū)與華大生命科學(xué)研究院所屬青島華大基因研究院共同開展的“千種海洋生物基因測序項目”重要組成部分。“千種海洋生物基因測序項目”主要內(nèi)容為海洋生物的基因樣本采集、高深度基因組測序等。(完)
